MI Miftahul Khoir II Karangrejo berdiri pada tahun 1979 yang diprakarsai

oleh para tokoh agama dan tokoh masyarakat yang menginginkan untuk membentuk suatu lembaga pendidikan yang berorientasi keagamaan Islam. Pada masa awal berdirinya MI Miftahul Khoir II Karangrejo proses kegiatan belajar mengajar dilaksanakan pada siang hari dengan siswa yang mayoritas pada pagi harinya bersekolah di sekolah pagi

Setelah berjalan beberapa tahun akhirnya MI Miftahul Khoir II melaksanakan proses kegiatan belajar mengajar pada pagi hari dan tidak ubahnya seperti lembaga-lembaga pendidikan pada umumnya. Meski bukan lembaga pendidikan yang dananya selalu disubsidi oleh pemerintah, lambat laun sekolah ini menjadi pilihan favorit masyarakat Karangtengah Karangrejo Purwosari.

Pada saat ini MI Miftahul Khoir II Karangrejo sudah mampu bersaing dalam dunia pendidikan khususnya ditingkat dasar, yang terbukti dengan meningkatnya kuantitas dan kualitas peserta didik dari tahun ke tahun. Alhamdulillah selama lima tahun terakhir siswa MI Miftahul Khoir II Karangrejo mencapai diatas 100 serta 80 % dari tenaga pendidik dan kependidikan sudah bersertifikasi.